Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
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