Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO1B3Q9NPD5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLCO1B3Q9NPD5 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms