Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC17Q9NP64 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms