Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC52A2Q9HAB3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms