Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms