Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms