Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SERPINA9-201ENST00000298845 1423 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AIRN-202ENST00000609176 1489 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTS-204ENST00000525803 625 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC024267.5-201ENST00000579154 599 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms