Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC32Q9BV29 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC32Q9BV29 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC32Q9BV29 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC32Q9BV29 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC32Q9BV29 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC32Q9BV29 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC32Q9BV29 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC32Q9BV29 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC32Q9BV29 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC32Q9BV29 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC32Q9BV29 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC32Q9BV29 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC32Q9BV29 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC32Q9BV29 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC32Q9BV29 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC32Q9BV29 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC32Q9BV29 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC32Q9BV29 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms