Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SYT17Q9BSW7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT17Q9BSW7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT17Q9BSW7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT17Q9BSW7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT17Q9BSW7 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT17Q9BSW7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT17Q9BSW7 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT17Q9BSW7 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT17Q9BSW7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT17Q9BSW7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT17Q9BSW7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT17Q9BSW7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT17Q9BSW7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT17Q9BSW7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT17Q9BSW7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT17Q9BSW7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT17Q9BSW7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT17Q9BSW7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT17Q9BSW7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT17Q9BSW7 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT17Q9BSW7 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT17Q9BSW7 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT17Q9BSW7 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT17Q9BSW7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT17Q9BSW7 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT17Q9BSW7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT17Q9BSW7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT17Q9BSW7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT17Q9BSW7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT17Q9BSW7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT17Q9BSW7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT17Q9BSW7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT17Q9BSW7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms