Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC39A3Q9BRY0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms