Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms