Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBL7Q96S82 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms