Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KC1Q96S38 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms