Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms