Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NXPE2Q96DL1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms