Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms