Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA4DQ92854 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms