Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms