Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROM2Q8N271 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROM2Q8N271 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms