Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APTXQ7Z2E3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms