Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FGD6Q6ZV73 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms