Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms