Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LMOD2Q6P5Q4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms