Protein–RNA interactions for Protein: Q6L9W6

B4GALNT3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT3Q6L9W6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
B4GALNT3Q6L9W6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
B4GALNT3Q6L9W6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
B4GALNT3Q6L9W6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
B4GALNT3Q6L9W6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
B4GALNT3Q6L9W6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
B4GALNT3Q6L9W6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
B4GALNT3Q6L9W6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms