Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9A4Q6AI14 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SLC9A4Q6AI14 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9A4Q6AI14 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9A4Q6AI14 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9A4Q6AI14 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9A4Q6AI14 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9A4Q6AI14 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9A4Q6AI14 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9A4Q6AI14 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9A4Q6AI14 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9A4Q6AI14 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9A4Q6AI14 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9A4Q6AI14 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9A4Q6AI14 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9A4Q6AI14 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms