Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C9orf84Q5VXU9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
C9orf84Q5VXU9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C9orf84Q5VXU9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C9orf84Q5VXU9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C9orf84Q5VXU9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C9orf84Q5VXU9 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C9orf84Q5VXU9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C9orf84Q5VXU9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
C9orf84Q5VXU9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C9orf84Q5VXU9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C9orf84Q5VXU9 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C9orf84Q5VXU9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C9orf84Q5VXU9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C9orf84Q5VXU9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C9orf84Q5VXU9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C9orf84Q5VXU9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C9orf84Q5VXU9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C9orf84Q5VXU9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C9orf84Q5VXU9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C9orf84Q5VXU9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C9orf84Q5VXU9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C9orf84Q5VXU9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C9orf84Q5VXU9 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C9orf84Q5VXU9 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
C9orf84Q5VXU9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C9orf84Q5VXU9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C9orf84Q5VXU9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C9orf84Q5VXU9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
C9orf84Q5VXU9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
C9orf84Q5VXU9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf84Q5VXU9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms