Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms