Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PCID2Q5JVF3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms