Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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