Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms