Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms