Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 HTR4-207ENST00000520514 1236 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 AC123767.1-204ENST00000523523 273 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 AC008033.3-201ENST00000612531 1407 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 AC131649.1-201ENST00000569215 1313 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 HGNC:18790-207ENST00000505246 973 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 AC087289.4-201ENST00000587348 230 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 AC004918.3-201ENST00000602609 925 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 AC012454.1-201ENST00000443948 995 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 LYRM7-203ENST00000510516 604 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms