Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
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