Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
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