Protein–RNA interactions for Protein: Q15669

RHOH, Rho-related GTP-binding protein RhoH, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOHQ15669 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOHQ15669 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RHOHQ15669 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms