Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIP4Q15650 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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