Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHBQ15464 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHBQ15464 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHBQ15464 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHBQ15464 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHBQ15464 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHBQ15464 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHBQ15464 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHBQ15464 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHBQ15464 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHBQ15464 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHBQ15464 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHBQ15464 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHBQ15464 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SHBQ15464 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHBQ15464 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHBQ15464 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SHBQ15464 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SHBQ15464 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHBQ15464 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHBQ15464 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHBQ15464 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHBQ15464 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHBQ15464 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHBQ15464 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHBQ15464 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHBQ15464 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHBQ15464 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHBQ15464 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHBQ15464 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHBQ15464 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHBQ15464 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHBQ15464 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHBQ15464 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHBQ15464 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHBQ15464 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHBQ15464 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHBQ15464 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHBQ15464 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SHBQ15464 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHBQ15464 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHBQ15464 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SHBQ15464 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHBQ15464 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHBQ15464 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHBQ15464 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHBQ15464 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHBQ15464 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHBQ15464 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHBQ15464 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHBQ15464 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHBQ15464 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHBQ15464 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHBQ15464 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHBQ15464 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHBQ15464 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHBQ15464 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHBQ15464 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHBQ15464 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHBQ15464 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHBQ15464 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHBQ15464 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHBQ15464 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SHBQ15464 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SHBQ15464 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHBQ15464 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHBQ15464 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHBQ15464 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHBQ15464 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SHBQ15464 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHBQ15464 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHBQ15464 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHBQ15464 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHBQ15464 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHBQ15464 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHBQ15464 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SHBQ15464 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHBQ15464 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHBQ15464 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHBQ15464 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHBQ15464 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHBQ15464 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SHBQ15464 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHBQ15464 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHBQ15464 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHBQ15464 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHBQ15464 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHBQ15464 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHBQ15464 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHBQ15464 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHBQ15464 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHBQ15464 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHBQ15464 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHBQ15464 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHBQ15464 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SHBQ15464 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHBQ15464 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SHBQ15464 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHBQ15464 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHBQ15464 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms