Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PTPRKQ15262 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
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PTPRKQ15262 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
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PTPRKQ15262 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
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PTPRKQ15262 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
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PTPRKQ15262 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
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PTPRKQ15262 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
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PTPRKQ15262 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
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PTPRKQ15262 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
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