Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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