Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCARF1Q14162 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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