Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCINQ13939 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCINQ13939 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCINQ13939 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCINQ13939 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCINQ13939 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCINQ13939 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCINQ13939 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCINQ13939 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCINQ13939 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCINQ13939 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCINQ13939 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCINQ13939 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCINQ13939 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCINQ13939 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCINQ13939 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCINQ13939 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCINQ13939 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCINQ13939 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCINQ13939 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCINQ13939 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCINQ13939 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCINQ13939 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCINQ13939 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCINQ13939 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCINQ13939 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCINQ13939 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCINQ13939 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCINQ13939 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCINQ13939 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCINQ13939 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCINQ13939 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCINQ13939 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCINQ13939 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCINQ13939 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCINQ13939 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCINQ13939 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCINQ13939 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCINQ13939 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCINQ13939 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCINQ13939 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCINQ13939 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCINQ13939 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCINQ13939 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCINQ13939 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCINQ13939 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCINQ13939 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCINQ13939 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCINQ13939 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCINQ13939 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCINQ13939 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCINQ13939 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCINQ13939 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms