Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1CQ13936 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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