Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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