Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ATRQ13535 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATRQ13535 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATRQ13535 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATRQ13535 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATRQ13535 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATRQ13535 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATRQ13535 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ATRQ13535 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATRQ13535 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATRQ13535 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATRQ13535 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATRQ13535 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATRQ13535 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATRQ13535 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATRQ13535 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATRQ13535 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATRQ13535 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATRQ13535 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATRQ13535 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATRQ13535 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATRQ13535 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATRQ13535 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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