Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
XRCC4Q13426 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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