Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
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AP3B2Q13367 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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AP3B2Q13367 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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AP3B2Q13367 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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