Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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ITGB3BPQ13352 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
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ITGB3BPQ13352 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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ITGB3BPQ13352 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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ITGB3BPQ13352 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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ITGB3BPQ13352 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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ITGB3BPQ13352 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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ITGB3BPQ13352 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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ITGB3BPQ13352 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
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ITGB3BPQ13352 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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ITGB3BPQ13352 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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ITGB3BPQ13352 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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ITGB3BPQ13352 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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ITGB3BPQ13352 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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ITGB3BPQ13352 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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ITGB3BPQ13352 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGB3BPQ13352 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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