Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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