Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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SKP2Q13309 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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SKP2Q13309 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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SKP2Q13309 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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SKP2Q13309 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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SKP2Q13309 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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SKP2Q13309 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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