Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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SEMA3FQ13275 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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SEMA3FQ13275 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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SEMA3FQ13275 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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SEMA3FQ13275 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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SEMA3FQ13275 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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SEMA3FQ13275 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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SEMA3FQ13275 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3FQ13275 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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